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长期使用医用呼吸机后，内部易滋生微生物，会对患者造成严重危害。微生物于呼吸机内部繁衍，会污染气体输送系统，导致输送给患者的气体携带大量细菌、病毒等病原体。患者吸入被污染气体，极可能引发呼吸道感染，特别是抵抗力低的患者，感染风险更高，甚至可能诱发严重肺部疾病。而且，微生物滋生还可能影响呼吸机正常运转，导致设备故障，影响治疗效果。
为防范和处理微生物滋生问题，需采取系列措施。应定期清洁与消毒呼吸机。依照设备制造商建议，对呼吸机各部件，像呼吸管道、湿化器、过滤器等进行拆卸、清洗及消毒。同时，保持呼吸机使用环境清洁，定期更换空气过滤器，降低空气中灰尘与微生物进入呼吸机的几率。使用时，注意控制湿化器水位，防止水分过多滋生细菌。
若已出现微生物滋生状况，需及时停用医用呼吸机，并对其进行全面消毒。可运用化学消毒剂浸泡、高温去菌等方式，确保杀灭微生物。
此外，要密切观察患者，及时察觉并处理可能出现的感染症状。
